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没有PCF(CODEX),这篇Cancer Cell文章就少了一半灵魂,空间单细胞蛋白组揭开PD-1阻断治疗背后的浆细胞密码!

没有PCF(CODEX),这篇Cancer Cell文章就少了一半灵魂,空间单细胞蛋白组揭开PD-1阻断治疗背后的浆细胞密码!

【概要描述】PCF(CODEX)空间蛋白组+单细胞BCR双剑合璧,把肿瘤里的"好抗体"变成CAR-T精准导弹

没有PCF(CODEX),这篇Cancer Cell文章就少了一半灵魂,空间单细胞蛋白组揭开PD-1阻断治疗背后的浆细胞密码!

【概要描述】PCF(CODEX)空间蛋白组+单细胞BCR双剑合璧,把肿瘤里的"好抗体"变成CAR-T精准导弹

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PD-1抑制剂治疗非小细胞肺癌(NSCLC)后,肿瘤内部为何会出现大量浆细胞浸润?这些浆细胞分泌的抗体到底针对什么抗原?能否被"变废为宝"用于开发新的肿瘤疗法?近期,杜克大学团队在《Cancer Cell》发表了题为“Tumor-infiltrating plasma cell profiling after PD-1 blockade reveals tumor-specific antibodies”的研究论文。该研究通过PCF(CODEX)空间单细胞蛋白组+单细胞BCR测序+重组抗体功能验证,首次系统证明了PD-1阻断诱导的肿瘤浸润浆细胞是抗肿瘤抗体的富集来源,且其识别的瓜氨酸化波形蛋白可作为CAR-T靶点,在免疫健全模型中实现无脱靶毒性的抗肿瘤效果。

研究采用了"PCF(CODEX)空间单细胞蛋白组+单细胞转录组BCR测序”前期数据挖掘的并行策略。PCF(CODEX)空间单细胞蛋白组提供了TLS成熟度和细胞空间组织的信息,scRNA-seq提供了BCR序列和B细胞分化状态。两者不是简单的"堆砌",而是回答不同层面的问题。当样本有限但希望同时获得空间信息和单细胞分子信息时,这种"分而治之"的策略非常实用。石蜡标本做PCF(CODEX)空间单细胞蛋白组获取空间架构,新鲜/冷冻标本做scRNA-seq获取分子深度。

 

研究揭示了NSCLC肿瘤中存在从naive到终末分化的完整B细胞谱系,发现了肿瘤浸润B细胞(TIL-B)在瘤内经历了抗原驱动的亲和力成熟和分化。研究进一步揭示了来自多种TIL-B群体的抗体具有肿瘤细胞表面反应性,尤其是先导抗体PC-1展现出最强、最广泛的肿瘤细胞表面结合活性。研究通过20K人类蛋白组芯片等多种技术组合鉴定出PC-1识别瓜氨酸化波形蛋白,同时交叉识别瓜氨酸化钙网蛋白、p53和Hsp90,并解析了PC-1 Fab的晶体结构,预测了识别靶点的构象特征。

功能实验验证了PC-1不仅能结合肿瘤细胞,还能结合促肿瘤巨噬细胞、MDSCs和衰竭CD4⁺ T细胞,但不结合健康人PBMC或配对正常组织。构建的PC-1 CAR-T在体外和体内均展现强力抗肿瘤活性,在免疫健全模型中无任何可检测的脱靶器官毒性。PAD2是将精氨酸转化为瓜氨酸的关键酶。PAD2酶敲除后PC-1结合消失,直接证明了PC-1识别的确实是瓜氨酸化抗原而非其他修饰或非修饰抗原。

|   PCF(CODEX)空间单细胞蛋白组在该研究中的核心价值

这项研究开始直接利用了PCF(CODEX)空间单细胞蛋白组,对3例NSCLC术后手术标本(含1例术前活检对照)进行了检测,共检测了45种抗体

PCF(CODEX)空间单细胞蛋白组在该研究中是不可替代的,它为整个研究的科学假说提供了空间组织层面的核心证据:PD-1阻断诱导的成熟TLS及其中的浆细胞是肿瘤特异性抗体的来源。没有PCF(CODEX),研究者将丢失空间维度的证据链,难以完整回答:(1)这些肿瘤特异性抗体在哪里产生?(2)它们产生的免疫结构基础是什么?,这两个前置性问题。这提示我们,在肿瘤免疫学研究中,PCF(CODEX)空间单细胞蛋白组已经从"锦上添花"变成了"不可或缺"的组成部分。

具体而言:

1. 空间多维度解析肿瘤免疫微环境

PCF(CODEX)使研究者在一个组织切片上同时检测了 40+ 种蛋白标志物。PCF(CODEX)通过Barcode偶联抗体和循环成像技术,突破了低通量蛋白检测这一限制,最多实现100+蛋白检测,实现了真正意义上的超高重蛋白原位分析。

2. 可视化并量化三级淋巴结构(TLS)的空间组织

PCF(CODEX)使研究者能够在整体组织切片上空间定位TLS,并将TLS内的细胞进行邻域聚类分析,将细胞归类到不同的空间邻域。根据细胞组成和Ki67增殖活性将TLS分为三个成熟状态:未成熟、静止成熟、增殖成熟。量化每个组织中TLS的细胞组成比例、B细胞Ki67+分数、TLS密度等指标。

3. 揭示PD-1阻断前后免疫微环境重塑

PCF(CODEX)提供了治疗前后组织样本(治疗前穿刺 vs 治疗后切除标本)的直观空间对比,清楚地展示了PD-1阻断后TLS数量显著增加,包含GC CD4+ T细胞、Ki67+CD20+ B细胞及周围环绕的CD138+CD38+浆细胞的成熟TLS大量出现,并发现了CD138+CD38+浆细胞在肿瘤基质和实质中广泛分布。

4. 将空间信息与病理反应关联

PCF(CODEX)使研究者能够将TLS密度、成熟状态等空间参数与患者的病理缓解率进行关联分析,为理解免疫治疗疗效的空间决定因素提供了关键数据。

| 参考文献

Meyerhoff RR, Chen A, O'Brien J, Anadon CM et al. Tumor-infiltrating plasma cell profiling after PD-1 blockade reveals tumor-specific antibodies. Cancer Cell. 2026:S1535-6108(26)00310-7.

 

足球情报网作为Akoya公司官方认证的PCF空间单细胞蛋白组技术服务商,现已建成了完善和成熟的服务体系。足球情报网目前拥有150+现货抗体,已经积累了多种组织类型检测经验,合作客户发表多篇高分文章

1)Cell|樊嘉院士领衔团队首次揭示癌症细胞利用跨器官的神经免疫回路逃避免疫监视的调控机制

2)Cell|全球首例 海军军医大学上海长征医院徐沪济团队应用新型CAR-NK细胞疗法治疗难治性系统性硬化症患者

3)STTT(IF:52.7)|中国医学科学院肿瘤医院周光飚团队深入解析小细胞肺癌的分子特征和治疗靶点

4)《Sci Transl Med》|新桥医院张曦团队利用空间多组学揭示cGVHD皮肤纤维化的微环境机制

 

足球情报网的PCF80抗体panel全面覆盖免疫细胞谱系、肿瘤细胞表型、T细胞功能状态、B细胞TLS相关反应、髓系细胞异质性、免疫检查点、CAF与基质重塑、血管/淋巴管结构、细胞增殖、缺氧、代谢重编程及细胞命运调控等多个生物学维度。该panel可在组织中实现高维蛋白标志物的原位空间检测,用于系统解析组织微环境中的细胞组成、功能状态、空间邻域及细胞互作关系,为肿瘤免疫微环境、免疫治疗响应/耐药、TLS形成、TAM功能分型、CAF屏障、血管重塑和空间生物标志物挖掘等研究提供多维度空间分析框架。

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发布时间:2021-08-11 17:21:10

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发布时间:2023-06-09 17:38:30
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